Początki myślenickiej dwójki sięgają 1957 roku, kiedy to Powiatowa rada Narodowa w Myślenicach podjęła decyzję o budowie w mieście drugiej szkoły podstawowej.
Pod teren nowej szkoły przeznaczono 2 hektary z rozparcelowanych dóbr Lubomirskich, na których stały jeszcze zabudowania dworskie i spalony browar.
Budowa trwała od października 1957 roku do czerwca 1960 r. 1 września 1960 r. W Szkole podstawowej nr.2 rozpoczęło naukę 820 uczniów przeniesionych z "jedynki" i 16 nauczycieli.
Pierwszym kierownikiem został Ludwik Raczyński, Którego po kilku miesiącach zastąpił Antoni Miodoński.
Teren szkoły ogrodzono siatką drucianą, pozostała po czwartakach i stajniach dworskich.
Rozpoczęły się kilkuletnie prace porządkowe i usuwanie reszty zabudowań dworskich, plantowanie ziemi z wykopów, przygotowywanie terenu pod boiska i obiekty sportowe, zakładanie ogrodu kwiatowego.
W kraju podejmuje się czyny społeczne na XX lecie PRL, nauczyciele i uczniowie "dwójki" włączyli się też w akcję. Koło szkoły kwitną pierwsze rabaty, posadzono 480 drzew i 200 krzewów ozdobnych, Zakończono prace przy boiskach szkolnych. W pracach porządkowych, wyposażenie szkoły w sprzęt, tworzenie bazy, partycypują Zakłady Chemiczne Oświęcim, korzystające z budynku w czasie wakacji na kolonie letnie.
Budynek "dwójki" tętni życiem przez cały czas. Działają liczne koła przedmiotowe, organizacje uczniowskie, harcerstwo. Znalazły tu "gościnę" korespondencyjne Liceum Ogólnopolskie, Szkoła Rolnicza, Oświatowy Ośrodek Metodyczny i inne instytucje oświatowe.
Osiągnięcia dydaktyczne dostrzega Ministerstwo Edukacji Narodowej, uznając Szkołę Podstawową nr.2 za wiodącą w powiecie /22.04.1964/ i wyznaczają jej rolę przykładowego ośrodka pracy dla rejonu. W 1965 r. Rada Pedagogiczna zadecydował o założeniu Złotej Księgi dla najlepszych uczniów szkoły. W ciągu 35 lat wpisano do niej 8 tysięcy uczniów.
W roku 1967/68 powstała myśl, by szkoła przybrała imię. Największą ilość głosów zdobył projekt nazwania szkoły imieniem "Bohaterów Westerplatte". Rozpoczęto prace nad przygotowaniem uroczystości. Został powołany komitet sztandarowy złożony z nauczycieli, rodziców o uczniów.
Uroczystości nadania szkole imienia heroicznych obrońców Polski, "Bohaterów Westerplatte" , odbyły się 20 września 1969r. Odsłonięto tablicę pamiątkową, wręczono uczniom sztandar, chór wykonał po raz pierwszy pieśń autorstwa Jana Brzezińskiego, która została później hymnem szkoły.

W latach siedemdziesištych szkołę dotykają trudności finansowe. Kierownictwo szkoły z powodzeniem poszukuje sojuszników celem dokończenia prac modernizacyjnych. Rodzice i myślenickie zakłady pracy finansująą nawierzchnię asfaltową na boiska i alejki. Był to wkład społeczności szkolnej w obchody Roku Nauki Polskiej.
Szkole przybywa uczniów i oddziałów (1313 uczniów, 42 oddziały). Rośnie rzesza harcerzy-840 uczniów bawi się i uczy w 25 drużynach.
Prawdziwa mobilizacja sił następuje w roku szkolnym 1978/79 kiedy Kuratorium krakowskie wytypowało szkołę nr. 2 do realizacji eksperymentu 10 letniej szkoły średniej.
Pracą szkoły kieruje czteroosobowa dyrekcja. Mnożą się sukcesy sportowe (1 miejsce w wojewódzkich mistrzostwach piłki siatkowej dziewcząt) i dydaktyczne (11 laureatów olimpiad przedmiotowych).
W latach osiemdziesiątych nie mieścimy się w budynku. 1412 uczniów uczy się w 55 oddziałach. Szkoła zatrudnia 75 nauczycieli. Klasy 1,2 uczą się w wynajętych w mieście salach. Taki stan rzeczy potrwa do otwarcia w 1984 r. Szkoły Podstawowej nr.3. Z "Dwójki" odeszło 629 uczniów. To rok znamienny w historii szkoły także dlatego, że Wojewódzka Rada Narodowa w Krakowie nadała S.P. nr.2 Złotą Odznakę za zasługi dla Ziemi Krakowskiej. Zakończyło się wdrażanie 10-latki.
W latach 90tych władze oświatowe likwidują zajęcia pozalekcyjne, gimnastykę korekcyjną, obniżają siatkę godzin. Kłopoty finansowe szkoły łagodzi powstałe z inicjatywy dyr. St. Mistarz Stowarzyszenie Patronackie kierowane przez Edwarda Bodziocha i Adama Gizę.
Od 1 stycznia 1994 szkoły podstawowe przejmuje Gmina Myślenice. To czwarte dziesięciolecie szkoły dało wiele powodów do dumy:
Rok Jubileuszowy 1999/2000 to reforma oświaty. "Dwójka" zostaje 6 letnią szkołą podstawową. Przyjęliśmy 220 uczniów i 13 nauczycieli z "jedynki"